SHD催化三角洲
该 SHD催化三联体顾名思义，它由氨基酸（AAs）丝氨酸，组氨酸和天冬氨酸组成，其单字母代码分别为S，H和D.
例如，这种三联体存在于酶内 胰蛋白酶，可以在胰腺中找到，首先作为无活性前体合成（因此在需要之前它不起作用）。
胰蛋白酶切割特定的肽键
胰蛋白酶的想法是它应该水解特定的肽键，其中所讨论的肽键遵循特定的
突出显示的键是在发现突出显示时在酶活性期间水解的肽键
氨基酸的作用
丝氨酸 在这个三合会中会很棒 亲核试剂如果不是因为它有质子。将其去质子化会非常有帮助。要做到这一点，我们需要完成某些事情 降低丝氨酸的pKa 所以它想要捐出它的质子。
组氨酸 通过成为一个理想的解决方案 活化剂 丝氨酸由于组氨酸的pKa约为6.04，而中性丝氨酸的pKa约为15.9，因此它本身不太可能发生，尽管……
然而， 天冬氨酸 具有约3.90的pKa和负电荷，因此作为亲水性化合物，它希望是酸，使得组氨酸和天冬氨酸形成H-键相互作用。
天冬氨酸对组氨酸质子的渴望促使组氨酸进入 提高其pKa 保持其右上质子， 平衡 组氨酸和丝氨酸之间的pKa差异，促进丝氨酸的去质子化以形成H键相互作用。
作为额外奖励，天冬氨酸也 定向 组氨酸使其自由旋转的亚甲基桥保持在原位。太好了！
它们一起在胰蛋白酶中起作用，例如，催化其他蛋白质的特定肽键的水解/裂解。
那机制是什么？
嗯，这是这个大图：
- 组氨酸从丝氨酸中偷取一个质子，激活它。
- 丝氨酸现在能够攻击羰基碳，以四面体复合物结合。
- 该复合物由骨架稳定
# “NH” # 来自附近的甘氨酸，以及相同的丝氨酸。组氨酸以天冬氨酸为导向。四面体复合物塌缩以裂解肽键和所得物# “NH” # 偷取质子远离组氨酸。 - 组氨酸可以从水中获取质子，因为在被天冬氨酸稳定后，其pKa仍然被提升（使其成为较弱的酸）。
- 氢氧化物是一种很好的亲核试剂，然后可以攻击羰基碳进行第二次亲核攻击。
- 四面体复合物再次由骨架稳定
# “NH” # 在甘氨酸和相同的丝氨酸上，然后可以崩溃，直接切断丝氨酸并像以前一样从组氨酸中取出质子。 - 我们以羧酸结束，这是肽键水解的结果。