等位基因是同一基因的不同形式。孟德尔在豌豆植物中研究了七个特征，每个特征有两个等位基因，一个是显性的，一个是隐性的。通常，显性等位基因由大写字母表示，隐性等位基因由相同的字母表示，但是以小写字母表示，例如R和r。
豌豆植物花色等位基因的一个例子是显性紫色等位基因和隐性白色等位基因;对于身高，他们是主要的高等位基因和隐性短等位基因;对于豌豆颜色，它们是主要的黄色等位基因和隐性绿色等位基因。
(
并非所有特征都由显性和隐性等位基因控制。有时它们表现出不完全的优势，其中两个不同等位基因的存在产生两种表型的混合（性状的表达。不完全优势的一个例子包括快龙的花色。如果植物遗传两个红色等位基因，花将是红色;如果它继承了两个白色等位基因，花将是白色的;如果它继承了一个红色等位基因和一个白色等位基因，那么花将是粉红色的。
还有其他类型的遗传，都涉及各种性状等位基因的遗传。在人类中，每个特征都由等位基因的遗传决定，例如身高，肤色，眼睛颜色，头发颜色，血型，血红蛋白结构，甚至是否在唾液中分泌淀粉酶，或者可以品尝或闻到某些物质。许多特征不仅受一组等位基因的控制，而且甚至在不同的染色体上也有许多等位基因。遗传学领域非常有趣和令人兴奋。